Cách chơi của Steins;Gate đòi hỏi rất ít tương tác từ người chơi vì phần lớn thời gian dành cho các đoạn hội thoại giữa các nhân vật hoặc độc thoại của nhân vật chính. Cũng giống như các visual novel khác, sẽ có những bước ngoặt trong Steins;Gate nơi người chơi phải ra quyết định ảnh hưởng tới diễn biến tiếp theo của câu chuyện.

Ở những điểm quyết định này, Steins;Gate sử dụng hệ thống "điện thoại kích hoạt" (フォーントリガー, fōn torigā?, tiếng Anh: phone trigger system) tương tự như hệ thống "delusional trigger" được dùng trong Chaos;Head. Khi người chơi nhận được cuộc gọi từ ai đó, họ có quyền trả lời hoặc bỏ qua. Các tin nhắn nhận được có các từ đặc biệt được gạch dưới và làm nổi bật bằng màu xanh, giống như các đường liên kết trong trình duyệt web, ở đó người chơi có thể chọn vào để trả lời tin nhắn. Người chơi có thể bỏ qua hầu hết các cuộc gọi hay tin nhắn nhưng vẫn sẽ có thời điểm yêu cầu bắt buộc phải trả lời. Tùy thuộc vào lựa chọn của người chơi mà cốt truyện sẽ đi theo những hướng nhất định.[18]